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生物標記在臨床研究中的作用

更新時間:2024-08-06      點擊次數:205

當被要求診斷疾病時,醫療專業人員通常首先看的是癥狀。有些癥狀是一種疾病的特點;其他可能意味著許多事情。無論哪種方式,癥狀都表明了正在討論的任何一種情況的真相。

無論你在研究什么,可靠、穩健的指標都很重要,尤其是在臨床研究中。有時,臨床試驗倫理、實用行為的最佳指標是生物標志物。

這些被稱為生物標記,是生物組織或生物樣本的特征,可以通過研究來確定臨床受試者的功能、表達或行為。在生物分子臨床研究中,臨床對象是生物樣本,生物標記是允許研究人員表征和研究該組織以及可能與之相關的任何狀況或疾病的工具之一。

什么是生物標志物?

什么是生物標志物,為什么它們有用?

生物標記可以被定義為你正在研究的任何生物標本的特征。這些特征作為臨床、生物和醫學環境中使用的評估指標。生物標記可以被客觀地量化,然后被評估作為正常或致病行為的指標。生物標記也可以用作受試者對治療劑或干預的反應(陽性、陰性或中性)的指標。

所有的生物標記都來自生物樣本,所有生物樣本都有其特色的生物分子組成,可以分解成細胞和分子組成部分并進行分析。這些組成部分可以根據基因構成、決定其行為的過程或其發揮或不發揮的功能進行分析。

為了更好地理解生物標記的范圍,我們必須理解可測量的生物樣本的特性或特征可能起源于分子、組織學、放射學或生理學。生物標記可以像基因一樣精細APOE用于檢測結腸癌,或全身性高血糖用于檢測糖尿病。

生物標記的類型

不同生物標志物的類型和應用有很多重疊。人體系統的復雜性,尤其是在細胞水平上,意味著一件小事可能與一百件其他小事或大事聯系在一起,并代表著這些小事或大事。

BioChain的生物樣本以其分子生物標志物為特征,當在分子水平上討論生物標志物時,這種多功能性變得更加明顯。一個基因或蛋白質可以合理地用于測量、檢測和監測多種疾病、對治療的反應或體質。例如,脂質代謝蛋白APOE的過表達可用于檢測某些癌癥,而其低表達與阿爾茨海默病的風險有關。

盡管有這種多功能性,FDA將生物標志物分為7類風險、診斷、監測、預后、預測、反應和安全性。生物鏈提供的大多數生物標記屬于預后和預測生物標記的類別。

預測:用于測量臨床事件或結果的可能性和/或診斷出病癥或疾病后復發的可能性。如果預后呈陽性,預后生物標志物也可用于繪制恢復時間表。預后生物標記的一個例子是乳腺癌中HER2蛋白的過表達。

預測:用于確定群體、類型或類別的個體在與對比/對應個體進行比較時發展成某種狀況或疾病的可能性。乳腺癌基因1或2的突變被用作評估卵巢癌患者是否可能對某些治療產生積極反應的預測標記。

其他生物標記用于評估一些事情,如患者發展疾病的可能性,確定患者體內某種疾病的活性存在,監測該疾病,以及患者是否對治療有反應。

除了這些分類,臨床研究中使用的所有生物標志物也被分類為臨床的默認生物標記。


生物標志物在臨床研究中的作用

不是所有的生物標志物都可以用于臨床研究。為了在臨床試驗中有用,生物標記必須:

  1. 以合理的成本準確、定期地測量

  2. 道德上可及的

  3. 能夠傳達通過臨床評估(例如,體檢)不清楚的信息

  4. 最終對臨床決策有用

如所討論的,一個生物標記可以指示許多不同的狀況;大多數情況下,許多生物標志物被一起評估以獲得可靠的結果。一些非常成熟的生物標志物如總膽固醇,已被管理當局接受為合理的臨床終點或疾病的確定指標。然而,大多數生物標志物不屬于這一類別,必須與其他指標結合使用才能得出可靠的臨床結論。對于更顆粒的生物標志物,或分子水平的生物標志物來說尤其如此。

盡管生物標記很復雜,但它在成功的臨床研究中非常重要。生物標記的不同交叉或排列及其不同的表達水平用于臨床研究,以了解正常和患病的生理和分子過程。通過這種了解,科學家可以了解疾病的發展和相關的治療,開發藥物、治療技術和/或醫療設備,并制定臨床實踐的標準。

那么生物鏈在這里起什么作用呢?BioChain專門研究基因或分子生物標記。遺傳生物標記在各個領域的臨床研究中起著至關重要的作用,

包括腫瘤學、藥物基因組學和罕見遺傳疾病。BioChain為臨床研究人員提供他們在研究中使用的特征生物樣本。通過這些標本,可以實現生物標志物的表達、相互作用和相關的臨床學習。


為什么要表征生物樣本?

生物標記從系統或基于器官的分類(如高血糖)到更精細或基于分子的分類(如特定蛋白質)。盡管有這種多樣性,該術語生物標記常用于指分子種類。

分子生物標記可以是基因組(基因)或蛋白質組(蛋白質)。傳統上,給定的血液蛋白水平將代表蛋白質組生物標志物,而基因mRNA的變化將代表基因組生物標志物。

當組織的生物分子組成被表征時,生物樣本中所有潛在分子生物標記的列表被生成。在BioChain,我們提供大量用于臨床研究的具有特征的患病、正常和配對組織。這些生物樣本的特征是DNA、RNA和蛋白質;它們的分子特征,作為現有的或新的生物標記,可以在臨床試驗中用作對照或參考。


臨床研究中的分子生物標記

雖然只有少數分子生物標志物被FDA正式批準使用如同生物標志物在臨床研究中,每天仍有數千個生物標志物在臨床試驗中被使用和評估。

BioChain Institute,Inc .是一家為分子腫瘤學、組織病理學和其他臨床領域的研究提供高質量生物樣本的公司。因此,在我們的生物樣本中表征的標記全是分子的。

在BioChain,我們對生物樣本進行內部表征,以生成該樣本中的所有分子生物數據,包括突變水平、甲基化水平和蛋白質表達的信息;由于后者,這些標本可以在臨床研究中用作對照和參考。


基因組生物標記

BioChain的基因組生物標記可用于分析臨床受試者的遺傳組成,捕獲遺傳變異,如單核苷酸多態性、拷貝數變異和一般突變。基因組生物標記用于臨床研究,以識別疾病的遺傳傾向,預測治療反應,并指導個性化的醫學方法。


基因表達生物標志物

biochain攜帶各種高質量的生物樣本根據不同的基因表達生物標記或可用于臨床研究以評估基因表達的變化和程度的生物標記來表征。舉個例子,biochain的癌癥序列提供專門為癌熱點突變測序的組織。這些標本可作為石蠟包埋或新鮮冷凍樣品,使用深度測序下一代測序(NGS)方法進行高覆蓋率的表征。

BioChain提供具有以下基因表達生物標記的各種FFPE組織:

BRCA:BRCA1和BRCA2是與遺傳性乳腺癌和卵巢癌綜合征相關的基因。這些基因的突變增加了患乳腺癌、卵巢癌、前列腺癌和其他癌癥的風險。基因表達譜可以幫助識別這些基因的異常活動。

EGFR:表皮生長因子受體(EGFR)是一種通常與幾種類型的癌癥相關的基因,特別是非小細胞肺癌(非小細胞肺癌)。EGFR突變會導致不受控制的細胞生長和癌癥進展;測量這種生物標志物的表達可以指導靶向治療決策。

中規模集成電路(medium-scale integration的縮寫):微衛星不穩定性(MSI)是與DNA錯配修復缺陷相關的生物標志物。在某些類型的結腸直腸癌中經常發現高水平的MSI。MSI狀態可以幫助預測對稱為免疫檢查點抑制劑的免疫治療藥物的反應。

KRAS:KRAS是一種參與調節細胞分裂和生長的細胞信號通路的基因。KRAS基因突變常見于幾種類型的癌癥,包括結腸直腸癌、肺癌和胰腺癌。治療方案可以根據發現的KRAS突變進行調整。

人乳頭瘤病毒(人乳頭瘤病毒):人乳頭瘤病毒感染可導致病毒癌基因如E6和E7的發展,這些基因可促進細胞轉化和癌癥發展。人乳頭瘤病毒測試和基因表達譜可以幫助評估發展宮頸癌和其他生殖器和口咽癌的可能性。


DNA甲基化生物標志物

在DNA上添加甲基可以以不同的方式調節基因表達。異常的DNA甲基化模式與癌癥、自身免疫性疾病和其他疾病有關。biochain的甲基化DNA可用于癌癥的早期檢測、風險評估和監測治療反應。


表觀遺傳生物標記

生物鏈提供無細胞DNA無細胞血漿,以及血漿中的突變定量,所有這些對于在表觀遺傳學研究中評估生物標記都是有價值的。這些工具為研究與各種疾病相關的表觀遺傳修飾和遺傳改變提供了非侵入性方法。將這些方法整合到生物標志物評估中,可以提供對疾病發展和進展的分子機制的整體理解,最終導致診斷和治療干預的改進。


蛋白質生物標志物

BioChain的高質量蛋白質樣品可用作測量血液、尿液或腦脊液等體液中特定蛋白質水平的參考材料。它們可以指示疾病的存在、進展或對治療的反應。


空間表征的組織

最后,biochain以空間特征化組織的形式提供特征化的生物樣本。我們使用10x Visium和NanoString GeoMx技術來表征我們的組織,這些技術能夠捕獲給定組織樣本中存在的生物標記,以及它們相對于組織其余部分的空間背景和分布!

生物標記在臨床研究中的作用是廣泛而多樣的。從通過廣泛接受的標志物表達來確認已知疾病到發現新的基因組相互作用,生物標志物對于臨床研究的必要性再清楚不過了。反過來,通過獲得高質量的生物樣本來獲得這些標記物,對于在研究過程的各個階段工作的臨床科學家來說是無價的。


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